MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015508	GCC	2	6	51760	51765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715425
1002	NC_015508	AGA	2	6	51801	51806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715425
1003	NC_015508	TCT	2	6	51867	51872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715425
1004	NC_015508	GAGC	2	8	51924	51931	25 %	0 %	50 %	25 %	332715425
1005	NC_015508	GAGC	2	8	51960	51967	25 %	0 %	50 %	25 %	332715425
1006	NC_015508	CAG	2	6	51988	51993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715425
1007	NC_015508	GCC	2	6	52106	52111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715425
1008	NC_015508	ATC	2	6	52129	52134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715425
1009	NC_015508	ACT	2	6	52142	52147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715425
1010	NC_015508	GAA	2	6	52171	52176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715425
1011	NC_015508	GC	3	6	52212	52217	0 %	0 %	50 %	50 %	332715425
1012	NC_015508	GTG	2	6	52223	52228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715425
1013	NC_015508	TTC	2	6	52332	52337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715426
1014	NC_015508	CAG	2	6	52352	52357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715426
1015	NC_015508	GCC	3	9	52540	52548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715426
1016	NC_015508	CGA	2	6	52558	52563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715426
1017	NC_015508	CAT	2	6	52579	52584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715426
1018	NC_015508	CCGGC	2	10	52598	52607	0 %	0 %	40 %	60 %	332715426
1019	NC_015508	CAA	2	6	52651	52656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715426
1020	NC_015508	GCC	2	6	52734	52739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715426
1021	NC_015508	CTT	2	6	52910	52915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715426
1022	NC_015508	CGA	2	6	52965	52970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715426
1023	NC_015508	CGG	2	6	52980	52985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715426
1024	NC_015508	ATT	2	6	52995	53000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715426
1025	NC_015508	CTG	2	6	53003	53008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715426
1026	NC_015508	CATCC	2	10	53069	53078	20 %	20 %	0 %	60 %	332715426
1027	NC_015508	CAC	2	6	53125	53130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715426
1028	NC_015508	ACG	2	6	53169	53174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715426
1029	NC_015508	TGA	2	6	53203	53208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715426
1030	NC_015508	GGC	2	6	53242	53247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715426
1031	NC_015508	TGG	2	6	53262	53267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715426
1032	NC_015508	GCGG	2	8	53344	53351	0 %	0 %	75 %	25 %	332715426
1033	NC_015508	CGC	3	9	53372	53380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715426
1034	NC_015508	GGTC	2	8	53398	53405	0 %	25 %	50 %	25 %	332715426
1035	NC_015508	CGC	2	6	53532	53537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715426
1036	NC_015508	GAAATG	2	12	53603	53614	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332715426
1037	NC_015508	GGT	2	6	53670	53675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715427
1038	NC_015508	GGC	2	6	53724	53729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1039	NC_015508	GGA	2	6	53736	53741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715427
1040	NC_015508	TCG	2	6	53744	53749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1041	NC_015508	CGA	2	6	53754	53759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1042	NC_015508	CAG	2	6	53772	53777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1043	NC_015508	GCT	2	6	53808	53813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1044	NC_015508	CGG	2	6	53829	53834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1045	NC_015508	GAG	2	6	53836	53841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715427
1046	NC_015508	CTG	2	6	53890	53895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1047	NC_015508	CGC	2	6	53932	53937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715427
1048	NC_015508	CCGC	2	8	53981	53988	0 %	0 %	25 %	75 %	332715427
1049	NC_015508	GTC	2	6	54022	54027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1050	NC_015508	CGT	2	6	54045	54050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1051	NC_015508	GC	3	6	54085	54090	0 %	0 %	50 %	50 %	332715427
1052	NC_015508	GGC	2	6	54127	54132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1053	NC_015508	CCA	2	6	54162	54167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715427
1054	NC_015508	CAA	2	6	54180	54185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715427
1055	NC_015508	CTG	2	6	54190	54195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1056	NC_015508	ATCT	2	8	54202	54209	25 %	50 %	0 %	25 %	332715427
1057	NC_015508	GC	3	6	54378	54383	0 %	0 %	50 %	50 %	332715427
1058	NC_015508	GGC	2	6	54387	54392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1059	NC_015508	TCT	2	6	54443	54448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715427
1060	NC_015508	GCC	2	6	54504	54509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715427
1061	NC_015508	CCT	2	6	54541	54546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715427
1062	NC_015508	CGC	3	9	54554	54562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715427
1063	NC_015508	CGT	2	6	54585	54590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1064	NC_015508	GGC	2	6	54701	54706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1065	NC_015508	CAA	2	6	54720	54725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715427
1066	NC_015508	CGG	2	6	54792	54797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715427
1067	NC_015508	GGT	2	6	54825	54830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715427
1068	NC_015508	GC	4	8	54898	54905	0 %	0 %	50 %	50 %	332715427
1069	NC_015508	GGCCG	2	10	54964	54973	0 %	0 %	60 %	40 %	332715427
1070	NC_015508	ACA	2	6	54992	54997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715427
1071	NC_015508	GAA	2	6	55003	55008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715427
1072	NC_015508	CAGAA	2	10	55026	55035	60 %	0 %	20 %	20 %	332715427
1073	NC_015508	TC	3	6	55083	55088	0 %	50 %	0 %	50 %	332715427
1074	NC_015508	GCC	2	6	55089	55094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715427
1075	NC_015508	CAG	2	6	55114	55119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715427
1076	NC_015508	GA	3	6	55124	55129	50 %	0 %	50 %	0 %	332715427
1077	NC_015508	TCG	2	6	55195	55200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1078	NC_015508	GAC	2	6	55201	55206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1079	NC_015508	CGT	2	6	55241	55246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1080	NC_015508	CAT	2	6	55328	55333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715428
1081	NC_015508	CTGG	2	8	55343	55350	0 %	25 %	50 %	25 %	332715428
1082	NC_015508	TCG	2	6	55357	55362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1083	NC_015508	TCG	2	6	55399	55404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1084	NC_015508	GAAG	2	8	55469	55476	50 %	0 %	50 %	0 %	332715428
1085	NC_015508	CGCT	2	8	55477	55484	0 %	25 %	25 %	50 %	332715428
1086	NC_015508	CT	3	6	55483	55488	0 %	50 %	0 %	50 %	332715428
1087	NC_015508	GAC	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1088	NC_015508	GGC	2	6	55647	55652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1089	NC_015508	GCAACT	2	12	55657	55668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332715428
1090	NC_015508	GGT	2	6	55669	55674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715428
1091	NC_015508	CCG	2	6	55702	55707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
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1094	NC_015508	CGA	2	6	55907	55912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1095	NC_015508	GC	3	6	55919	55924	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1096	NC_015508	CTG	2	6	55962	55967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1097	NC_015508	CAA	2	6	55997	56002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715428
1098	NC_015508	CAG	2	6	56013	56018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1099	NC_015508	CCG	2	6	56056	56061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
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1101	NC_015508	GCT	2	6	56096	56101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
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1103	NC_015508	GCA	2	6	56138	56143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1104	NC_015508	CGC	2	6	56248	56253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
1105	NC_015508	GCG	2	6	56275	56280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1106	NC_015508	CGGAAA	2	12	56305	56316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332715428
1107	NC_015508	CCG	2	6	56339	56344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
1108	NC_015508	TCA	2	6	56377	56382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715428
1109	NC_015508	GGC	2	6	56425	56430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1110	NC_015508	GCG	2	6	56441	56446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1111	NC_015508	CCG	3	9	56464	56472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
1112	NC_015508	CTGG	2	8	56491	56498	0 %	25 %	50 %	25 %	332715428
1113	NC_015508	TCC	2	6	56620	56625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715428
1114	NC_015508	GC	4	8	56744	56751	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1115	NC_015508	CTG	3	9	56760	56768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
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1119	NC_015508	ATGGA	2	10	57117	57126	40 %	20 %	40 %	0 %	332715428
1120	NC_015508	GCA	2	6	57175	57180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
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1122	NC_015508	GGAT	2	8	57221	57228	25 %	25 %	50 %	0 %	332715428
1123	NC_015508	GTC	2	6	57237	57242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1124	NC_015508	GCC	2	6	57261	57266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715428
1125	NC_015508	TGA	2	6	57302	57307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715428
1126	NC_015508	A	6	6	57378	57383	100 %	0 %	0 %	0 %	332715428
1127	NC_015508	CG	3	6	57453	57458	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1128	NC_015508	GATC	2	8	57496	57503	25 %	25 %	25 %	25 %	332715428
1129	NC_015508	GGC	2	6	57587	57592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1130	NC_015508	GGT	2	6	57690	57695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715428
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1132	NC_015508	GAAC	2	8	57734	57741	50 %	0 %	25 %	25 %	332715428
1133	NC_015508	CAA	2	6	57757	57762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715428
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1135	NC_015508	CTG	2	6	57825	57830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1136	NC_015508	CAG	2	6	57831	57836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1137	NC_015508	GCTC	2	8	57895	57902	0 %	25 %	25 %	50 %	332715428
1138	NC_015508	CG	4	8	58007	58014	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1139	NC_015508	TTC	2	6	58071	58076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715428
1140	NC_015508	GAC	3	9	58106	58114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
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1142	NC_015508	CAG	2	6	58157	58162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1143	NC_015508	CG	3	6	58198	58203	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1144	NC_015508	CGG	2	6	58231	58236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1145	NC_015508	TAT	2	6	58317	58322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715428
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1147	NC_015508	CG	3	6	58360	58365	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1148	NC_015508	CGG	2	6	58403	58408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1149	NC_015508	GCA	2	6	58412	58417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1150	NC_015508	GAT	2	6	58488	58493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715428
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1152	NC_015508	AGG	2	6	58644	58649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1153	NC_015508	AGGC	2	8	58662	58669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_015508	TTC	2	6	58756	58761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715429
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1211	NC_015508	TTGA	2	8	61558	61565	25 %	50 %	25 %	0 %	332715431
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1222	NC_015508	CAA	2	6	62194	62199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1223	NC_015508	GAAA	2	8	62235	62242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1224	NC_015508	GGC	2	6	62333	62338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1225	NC_015508	CAA	2	6	62378	62383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1226	NC_015508	GCCC	2	8	62403	62410	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1227	NC_015508	GCA	2	6	62486	62491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715432
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1230	NC_015508	TCG	2	6	62846	62851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715432
1231	NC_015508	AGC	2	6	62909	62914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715433
1232	NC_015508	CGGAC	2	10	62934	62943	20 %	0 %	40 %	40 %	332715433
1233	NC_015508	GAT	2	6	62955	62960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715433
1234	NC_015508	GCC	2	6	63010	63015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715433
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1236	NC_015508	GCG	2	6	63040	63045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715433
1237	NC_015508	TTG	2	6	63173	63178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715433
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1239	NC_015508	TCC	2	6	63218	63223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715433
1240	NC_015508	GAA	2	6	63342	63347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_015508	CGC	2	6	63426	63431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1242	NC_015508	AG	3	6	63509	63514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_015508	TCA	2	6	63529	63534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_015508	ACC	2	6	63544	63549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1245	NC_015508	GTC	2	6	63584	63589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715434
1246	NC_015508	GGAAA	2	10	63601	63610	60 %	0 %	40 %	0 %	332715434
1247	NC_015508	GAC	2	6	63633	63638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715434
1248	NC_015508	CCG	2	6	63681	63686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715434
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1250	NC_015508	TGA	2	6	63722	63727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715434
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1377	NC_015508	CGG	2	6	69728	69733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715438
1378	NC_015508	ATC	2	6	69745	69750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715438
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1383	NC_015508	CTT	2	6	70074	70079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715439
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1400	NC_015508	CG	3	6	70813	70818	0 %	0 %	50 %	50 %	332715440
1401	NC_015508	AGGC	2	8	70848	70855	25 %	0 %	50 %	25 %	332715440
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1411	NC_015508	TCG	2	6	71295	71300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715440
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1437	NC_015508	ATCG	2	8	72628	72635	25 %	25 %	25 %	25 %	332715441
1438	NC_015508	CTG	2	6	72662	72667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715441
1439	NC_015508	GCTG	2	8	72714	72721	0 %	25 %	50 %	25 %	332715441
1440	NC_015508	TCG	2	6	72768	72773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715441
1441	NC_015508	GC	3	6	72896	72901	0 %	0 %	50 %	50 %	332715441
1442	NC_015508	TCA	2	6	72915	72920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715441
1443	NC_015508	GAA	2	6	72974	72979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_015508	CAACC	2	10	73007	73016	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1445	NC_015508	GAG	2	6	73109	73114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715442
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1447	NC_015508	GAG	2	6	73244	73249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715442
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1449	NC_015508	GAACA	2	10	73325	73334	60 %	0 %	20 %	20 %	332715442
1450	NC_015508	GCAA	2	8	73350	73357	50 %	0 %	25 %	25 %	332715442
1451	NC_015508	ACCGA	2	10	73367	73376	40 %	0 %	20 %	40 %	332715442
1452	NC_015508	CTG	2	6	73397	73402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715442
1453	NC_015508	GAA	2	6	73405	73410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715442
1454	NC_015508	ACC	2	6	73430	73435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715442
1455	NC_015508	CGT	2	6	73474	73479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715442
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1458	NC_015508	AGATC	2	10	73528	73537	40 %	20 %	20 %	20 %	332715442
1459	NC_015508	GCC	2	6	73598	73603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715442
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1461	NC_015508	CGG	2	6	73705	73710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715442
1462	NC_015508	CCGG	2	8	73720	73727	0 %	0 %	50 %	50 %	332715442
1463	NC_015508	TCG	2	6	73764	73769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715442
1464	NC_015508	CGA	2	6	73783	73788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715442
1465	NC_015508	AAG	2	6	73850	73855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715442
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1468	NC_015508	ACGATG	2	12	73991	74002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715443
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1470	NC_015508	TTC	2	6	74052	74057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715443
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1475	NC_015508	GGGT	2	8	74224	74231	0 %	25 %	75 %	0 %	332715443
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1482	NC_015508	ATG	2	6	74621	74626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715444
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1484	NC_015508	CAT	2	6	74683	74688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715444
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1487	NC_015508	GCT	2	6	74767	74772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715444
1488	NC_015508	GTT	2	6	74813	74818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715444
1489	NC_015508	TTC	2	6	74858	74863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715444
1490	NC_015508	TTC	2	6	74874	74879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715444
1491	NC_015508	GC	3	6	74916	74921	0 %	0 %	50 %	50 %	332715444
1492	NC_015508	GCC	2	6	74942	74947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715444
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1494	NC_015508	CAT	2	6	74987	74992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715444
1495	NC_015508	ATC	3	9	75050	75058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715444
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1498	NC_015508	CTTC	2	8	75229	75236	0 %	50 %	0 %	50 %	332715444
1499	NC_015508	CAG	2	6	75255	75260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715444
1500	NC_015508	GCC	2	6	75267	75272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715444

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